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日本进入“海洋时代”后，成立了专门培养女高中生船员的“蓝色人鱼”学院。活泼开朗的岬明音被任命为“晴风号”驱逐舰的舰长，而她最好的朋友、胆小慎重的萌香则担任航海长。出海实习的第三天，晴风号遭遇暴风雨，与舰队失散。当通讯恢复时，她们收到的第一条命令竟然是：“所有教官已撤离，从现在起你们是正式船员。舰长，请作出你的第一个判断。”明音还没反应过来，雷达上就出现了不明舰艇的信号，而且不止一艘。更诡异的是，晴风号的鱼雷发射管被远程锁定，无法操作。萌香看着海图突然脸色惨白：“明音，我们不在实习海域。我们被送到…争议海域了。”而此时，一个陌生的女声切入了通讯频道：“晴风号，三十秒后若不改变航线，我方将视为敌对行为。”
这部动画最聪明的地方在于，它将硬核的军事知识与少女日常无缝衔接。前半段的校园生活越是轻松，后半段海上遭遇战的压迫感就越强。明音与萌香之间的信任危机与和解，成为了比炮火更扣人心弦的戏剧核心。最后一集的“无指令作战”堪称教科书级别的群像调度。
暴雨夜突发山洪，前特警与富家女被困缆车，而地面上的救援队里站着她的未婚夫。
一支国际科考队在深海发现非人类建筑遗迹，却唤醒了沉睡万年的古老战争机器。
江户时代一座专关女犯的牢房里，一位哑巴女囚用血写下了一部反抗史。
背包客女孩搭上一辆顺风车，途中发现司机车载广播正在全程直播“如何完美杀死搭车客”的游戏。
程序员小林家里住着一条龙，第二季又来了一条更麻烦的龙，而且暗恋托尔。
青青草原突然沉入地下，喜羊羊和灰太狼被迫联手对抗地心怪物。
愤怒鸟和捣蛋猪被迫联手，对抗一个要把他们所有岛屿都变成垃圾场的塑料垃圾怪物。
一位被警界开除的“过气神探”，在暴风雪山庄里为自己洗刷叛徒之名。